台塑六輕的石化汙染到底危害雲林人健康至何種程度，因無長期監測報告眾說紛紜，一旦發生公害，農漁民受損求償無門，雲縣府決定利用台塑捐的農業安定基金六千多萬元，投入農業環境監測，以取得公害糾紛調處的籌碼。據了解，台塑得知也已找專家進行類似監測。
去年六輕廠連續發生火災，台塑分四年回饋卅億元農業安定基金，每年七億五千萬元，縣府先前已委託給台大教授詹長權進行健康風險評估，明年再以六千兩百萬元進行農林漁牧生態及環境監測報告。
環保局長葉德惠指出，以元長落花生受臭氧影響一案為例，臭氧雖非六輕直接排放，但可能是六輕的大量氮氧化物、揮發性有機物經光化學反應造成，這種監測沒人做，因為很難做，公害糾紛汙染調查若無數據很難成立。
中興大學環境工程研究所教授莊秉潔舉環保署監控資料顯示，六輕排放的戴奧辛、鎘、砷佔中台灣排放量的二○％、四○％、五五％，縣府必須盡快完成汙染源指紋圖譜，釐清六輕的責任歸屬。雖目前「模擬」雲林縣戴奧辛濃度分布雖與男性癌症死亡率有符合之處，但須透過監測取得數據。
農業局長呂政璋表示，據了解台塑公司也找人進行類似環境監測，監測內容與縣府應不同，縣府目的是找出公糾的科學證據。
莊秉潔解釋，有正確的方法論，就能獲學術界認同，雙方調查的汙染樣本應該很接近，「國內這個圈子很小」，若做得沒道理，可能連審查委員都找不到，只要做得公正就會有學者背書，但行政判斷就不一定。
全縣二十鄉鎮分三級，一級區麥寮、台西、四湖、口湖、東勢、褒忠、崙背七鄉鎮，每年做三次監測，二級區二崙、西螺、莿桐、林內、斗六、虎尾、土庫、元長、水林，一年兩次監測。
